La Coupe d'Afrique des clubs champions fut fondée en 1964. Elle se jouait alors uniquement en matchs aller-retour. En 1997, la coupe change de formule et devient la Ligue des Champions d'Afrique, sur le modèle de la Ligue des Champions d'Europe. Ainsi, les quarts de finale et les demi-finales sont-ils remplacés par deux groupes de quatre, avec matchs aller et retour, le vainqueur de chaque groupe étant qualifié en finale. La formule change légérement en 2001 par l'introduction des demi-finales pour les vainqueurs et les seconds des deux groupes.
En 2004, la compétition s'ouvre également à certains vice-champions nationaux évoluant dans les championnants les plus relevés en Afrique. Durant cette même année, la coupe prend le nom officiel de MTN CAF Champions League, à suite du parrainage de la compétition par l'entreprise sud-africaine MTN.