Le Football Club Nantes Atlantique, est un club de football français, fondé en 1943. Le club est présidé par Luc Dayan tandis que l'équipe première est entrainée par Michel Der Zakarian et son adjoint Baptiste Gentili. L'ancien joueur formé à Nantes Xavier Gravelaine occupe lui le poste de conseiller sportif. Le « FCNA » possède l'un des plus beaux palmarès du football français avec en particulier 8 titres de Championnat de France et 3 coupes de France. Le club est connu pour son « jeu à la nantaise », vif et technique, et pour son centre de formation qui produit régulièrement des joueurs de très bon niveau pour l'équipe première. De nombreux internationaux français sont sortis ce centre, dont Maxime Bossis, Henri Michel, Didier Deschamps, Christian Karembeu et Marcel Desailly.
Les débuts du FCN Le F.C. Nantes naît le 21 avril 1943 dans un café de la place du commerce, et officialisé par acte d’huissier (Mme Dauguet, rue Santeuil). Sous l'impulsion de Marcel Saupin, président de la Mellinet, cinq clubs nantais fusionnent . Saint-Pierre, Stade Nantais U.C., A.C. Batignolles, l'A.S.O. Nantaise et la Mellinet unissent leur force suivant le mot d'ordre de Saupin : « Petite équipe aujourd'hui, elle sera grande un jour si nous œuvrons ensemble. » Les couleurs jaune et verte sont choisies en référence à celles de l'écurie de chevaux de course de Jean Le Guillou, un des fondateurs du club. La Saint-Pierre de Nantes, venant de se classer en Division d'Honneur de la Ligue de l'Ouest cède alors sa place au FC Nantes. À l'issue de la première saison qui fut moyenne, le recrutement, géré par Saupin, Parlant et Hervé, s'oriente en région parisienne où de nombreux jeunes footballeurs émigraient vers la province afin d'éviter le Service du Travail Obligatoire en Allemagne. Marcel Braud est le premier président du F.C.N., mais Saupin en est le véritable patron. Saupin cherche alors un entraîneur de métier, qu'il trouve en la présence de Nuic, recommandant par ailleurs certains joueurs à Nantes, qu'il avait repéré lorsqu'il était à Paris. En 1944, Saupin est d'ailleurs porté à la présidence. En 1945 le FC Nantes remporte facilement la Coupe de l'Ouest en battant le S.O. Cholet 7-1, et devient également champion de l'Ouest en battant en finale le champion de Bretagne la T.A. de Rennes par 5 à 0. À la vue de ses résulats, de ses financements et du fait que Saupin soit un ami personnel de Gabriel Hanot,le FC Nantes rejoint alors le Groupement des Clubs Autorisés (GCA), en même temps que le SCO d'Angers et Angoulême, et devint par la même occasion une équipe professionnelle dès la fin de la guerre (juillet 1945). La deuxième division comportant deux groupes, Nantes se retrouve dans la zone Nord avec Nancy, le Stade Français, le CA Paris, Troyes, le SCO d'Angers, Le Mans, Amiens, Mulhouse, Colmar, Besançon, Douai, Valenciennes et Angoulême. Les joueurs conservent tout de même leur emploi en dehors du football.
Le premier match du FC Nantes en tant que professionnel se joue au Stade Olympique de Colombes, contre le C.A. Paris et une victoire 2-0. Le premier match à domicile est une défaite sur le même score contre l'A.S. Troyes (2600 spectateurs pour une recette de 118.045 anciens francs). Le club termine 5e pour cette première saison et l'entraîneur, Aimé Nuic, quitte Nantes pour Mulhouse suite à un différend. Antoine Raab lui succède alors en tant qu'entraineur-joueur. Après 16 matches consécutifs sans défaite, Nantes s'incline 9-0 à Sochaux, équipe en forme du moment. En 1953 la municipalité décide de donner de substantielles subventions au club afin de donner un coup de pouce à l'équipe pour la montée en division supérieure.
En 1992 le jeu fait son retour en même temps que Jean-Claude Suaudeau au poste d'entraîneur. Entre 92 et 97 le club gagnera un championnat, sera finaliste de la coupe de France et demi-finaliste de la ligue des champions. C'est l'éclosion de tout un groupe de jeunes joueurs proposant un football agréable : Japhet N'Doram, Patrice Loko, Reynald Pedros, Nicolas Ouédec, Claude Makélélé, Christian Karembeu... Entre 95 et 97 le club étant en proie à des difficultés financières, les meilleurs éléments partirent les uns après les autres, connaissant des fortunes diverses : Loko, Ouedec et Pedros tombèrent rapidement dans l'oubli ainsi que les transferts à répétiton, et disparurent de l'équipe de France peu après l'Euro 96, N'Doram dut se battre contre des blessures persistantes à Monaco, tandis que Karembeu et Makelele s'en sortirent mieux, réussissant à s'imposer à l'étranger (notamment au Real Madrid) et devenant des membres actifs de l'équipe de France. En 1996 un jeune gardien de but se fait remarquer en arrêtant un penalty à Bastia lors de sa première apparition : Mickaël Landreau. Las des transferts de ses meilleurs éléments à chaque fin de saison, Jean-Claude Suaudeau quitte définitivement le monde du football, et laisse place à son successeur évident : Raynald Denoueix, jusqu'alors chargé de la formation.
Alors que le club a fini 5e les deux saisons précédentes, Nantes fait partie des outsiders pour contrer le favori désigné : le Paris Saint-Germain. Champion d'automne avec dix points d'avance et aucune défaite, l'équipe ne sera jamais rejointe et ira même battre Paris 3-0 sur son terrain. Nantes gagna beaucoup de matches à domicile sur le score sans appel de 3-0, devenant ainsi le tarif maison.
Après l'exode de tous les joueurs du titre de 1995, le club stagne quelques saisons en milieu de tableau et finit par trouver un repreneur après le titre de champion obtenu en 2001 : la Socpresse qui nomme alors un président méconnaissant totalement le monde du football : Jean-Luc Gripond. Le 11 mars 2004, le nouveau propriétaire du club est Dassault, dans le cadre du rachat de la Socpresse par ce dernier. Celui-ci n'intervient nullement dans la gestion du club et laisse en place l'équipe dirigeante, montrant ainsi qu'il n'a jamais souhaité devenir propriétaire du FC Nantes, en cherchant seulement à ne pas perdre d'argent avec celui-ci. Lors de la saison 2003/04, Nantes s'incline face à Sochaux en finale de la coupe de la ligue aux tirs aux buts, suite à une Panenka manquée du capitaine et gardien Mickaël Landreau, privant ainsi le club de coupe d'Europe. La saison suivante est la plus mauvaise jamais réalisée depuis que le club est en Ligue 1 : Nantes se sauve lors de la dernière journée du championnat en finissant premier non-relégable : le club aura subi une crise sans précédent durant cette saison avec une fronde des joueurs menée par Landreau ayant pour issue le licenciement de l'entraineur Amisse, et les réactions très violentes de certains supporters notamment à Sochaux lors de la 37ème journée, envahissant le terrain, arrachant plus de 150 sièges, blessant quatre stadiers tout en cherchant en vain à molester le président Gripond. Lors de la trêve avant la saison du 2005/06, les cadres historiques du club (Robert Budzynski et Kléber Bobin à la direction, Mickaël Landreau, Frédéric Da Rocha pour les joueurs) sont invités à partir par l'équipe de Serge Dassault. Vahid Halilhodzic est également contacté pour devenir manager et entraineur, alors que Serge Le Dizet, entraineur actuel, n'est en place que depuis 6 mois. Jean-Luc Gripond est finalement remplacé par Rudi Roussillon le 28 juin 2005 en même temps que Robert Budzynski par Japhet N'Doram au poste de directeur sportif, lors d'une Assemblée Générale extraordinaire du groupe Dassault. Le club devient également une SA et non plus une SASP. Robert Budzynski quitte définitivement le club, en perte d'identité, le 8 octobre 2005 salué par une banderole adéquate.
Période 2006/07 : Georges Eo remplace Serge Le Dizet au poste d'entraineur le 20 septembre 2006, ce dernier se fait remplacer par le duo Michel Der Zakarian, Japhet N'Doram le 12 février 2007. C'est à l'issue de la saison 2006-2007 que le FCNA connait la relégation en Ligue 2 après 44 saisons passées au sein de l'élite.